Sinopsis
¡Establecer seis meses después de los acontecimientos de la original de Yu-Gi-Oh! manga, Yugi Muto y sus amigos están en su último año de escuela secundaria y están hablando de lo que van a hacer en el futuro. Mientras tanto, Seto Kaiba ha encargado una excavación para recuperar el Rompecabezas del Milenio desensamblado de las ruinas de la cámara del Milenio. El tema había albergado el alma de su rival, Atem, quien espera revivir el fin de resolver su puntuación. La excavación se ve interrumpida por un hombre misterioso, que se enfrenta a Kaiba en un juego de los monstruos del duelo y roba dos piezas del rompecabezas recuperado. ¿Cuál es su motivo ulterior? Las apuestas nunca han sido mayores; las rivalidades nunca como feroces; los riesgos no tan grande.